PCR實(shí)驗(yàn)常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案
以下是天正信達(dá)PCR實(shí)驗(yàn)常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案的系統(tǒng)性總結(jié):
一、擴(kuò)增失敗類(lèi)問(wèn)題
無(wú)擴(kuò)增條帶?
酶失活:更換新酶或不同品牌酶制劑
模板問(wèn)題:
• 含甲酸等雜質(zhì)(石蠟包埋樣本需特殊處理)
• 濃度不足(建議梯度稀釋驗(yàn)證)
溫度異常:校準(zhǔn)PCR儀溫度,變性溫度建議93-94℃/1min
假陰性結(jié)果?
引物降解:PAGE電泳驗(yàn)證引物完整性
抑制物干擾:純化模板或改用柱式提取試劑盒
退火溫度過(guò)高:梯度PCR優(yōu)化(推薦55-65℃范圍)
二、產(chǎn)物異常類(lèi)問(wèn)題
現(xiàn)象 主要原因 解決方案
非特異性條帶 引物二聚體/Mg2?濃度過(guò)高 降低引物量至0.1-1μM,調(diào)整Mg2?至1.5-2mM
拖尾/彌散 循環(huán)數(shù)過(guò)多/dNTP濃度偏高 減少循環(huán)至30-35次,dNTP濃度控制在200μM以下
產(chǎn)物量不足 延伸時(shí)間過(guò)短/模板量低 按1kb/min延長(zhǎng)延伸時(shí)間,增加模板至50-100ng
三、污染與質(zhì)控
假陽(yáng)性污染?
操作規(guī)范:
• 分裝試劑避免反復(fù)凍融
• 使用帶濾芯槍頭
環(huán)境控制:前/后PCR區(qū)域物理隔離
數(shù)字PCR優(yōu)化?
低頻突變檢測(cè):結(jié)合預(yù)擴(kuò)增技術(shù)可將靈敏度提升至0.1ppm
四、關(guān)鍵參數(shù)優(yōu)化
引物設(shè)計(jì)?:
• 長(zhǎng)度18-27bp,GC含量40-60%
• 避免3'端互補(bǔ)(BLAST驗(yàn)證特異性)
循環(huán)參數(shù)?:
變性94℃/30s → 退火(梯度優(yōu)化)→ 延伸72℃/1kb/min
注:白色孔板專(zhuān)用膜可提升低濃度樣本檢測(cè)信號(hào)強(qiáng)度
注:以上資料僅供參考,如需完整產(chǎn)品說(shuō)明,建議聯(lián)系供應(yīng)商獲取最新版本.
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